在地打造PCR行動實驗室
採訪/周玉文、張孟媛
整理/周玉文
4月初,台灣爆發新一波嚴重特殊傳染性肺炎(COVID-19,簡稱新冠肺炎)疫情,發病時間更短、傳播力更高的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2,簡稱新冠病毒)變異株Omicron讓確診病例數持續攀升,引發各界關注台灣的PCR核酸檢測量能是否足夠。
自從全球疫情蔓延以來,PCR(polymerase chain reaction,聚合酶連鎖反應)已經成為社會大眾朗朗上口的名詞,即便如今也普遍使用快篩試劑,但確診與否,仍是要做了PCR核酸檢測、通報衛福部疾管署確認了才算數。截至4月中旬,衛福部指定的COVID-19醫檢機構共有251家,PCR核酸檢測的每日檢驗量能超過19萬件。
瑞基海洋生物科技是2020年台灣第一家取得衛福部專案製造授權的COVID-19 PCR系統商,市場佔有率高達35%。他們與病毒纏鬥兩年多,目睹病毒快速變異、強力傳播,今年初才完成交接的前、後任執行長張曉芬、鍾德豫日前接受《科學人》雜誌專訪,透露設計PCR檢測試劑與開發設備的種種心法,也預見未來核酸檢測的應用與市場方向。
瑞基早一步看到PCR核酸檢測的需求持續成長,「往後可能會再持續擴張。」新冠病毒不會離去,人類隨時可能再面對新興的傳染病。一套可以因應不同病原體、現場即時進行PCR核酸檢測的設備,未來將變得更普遍。以下是專訪紀要:
採用人病規格,切入畜產、水產現場的PCR檢測
《科學人》(以下簡稱問):瑞基海洋生技的PCR核酸檢測儀原先是針對畜產、水產市場,跨足人類疾病在你們預期中嗎?
張曉芬(以下簡稱張):瑞基海洋生技的前身叫做銳基國際,是1993年左右成立。公司總部原本在台北,2002年搬遷到台中,2004年改為現在的名稱。
2009年瑞基海洋生技取得ISO13485證照(編按:全球公認的醫療設備產業品質管理標準),在那個時機點,瑞基在水產市場已小有成果,想積極拓展市場,考量伴侶動物及畜產市場法規較為寬鬆、切入相對容易,所以轉型一開始就設定從寵物、家畜、家禽疾病檢測起步,再往人類疾病發展。雖然動物疾病檢測市場的法規沒有人病那麼嚴格,我們仍是用人病的規格研發動物疾病的試劑與機器設備。
在新冠肺炎疫情爆發之前,我們已經在為人病市場做準備,除了取得ISO13485認證,瑞基廠房在2012年通過台灣優良製造廠商(GMP)認證,現場檢測設備陸續獲得歐盟體外診斷(CE-IVD)認證及台灣衛福部的醫療器材認證。試劑產品方面,也推出登革熱檢測試劑、腸胃道疾病的困難腸梭菌及諾羅病毒檢測試劑,皆已獲得CE-IVD認證。
問:那時候,動物疾病的現場核酸檢測算是紅海市場還是藍海市場?
張:現場檢測在十幾年前是藍海市場,法規較為寬鬆,相對來說競爭少一些。當時快篩當道,比較大的國際廠商都採用那樣的方式做。正如現在大家都知道,新冠病毒快篩的靈敏度與專一性比PCR核酸檢測差,但是當時確實沒有更好的PCR現場檢測設備。
鍾德豫(以下簡稱鍾):我補充一下。當時快篩偵測的標的是抗原;不過我們做PCR是核酸檢測,精準針對病原體的DNA或是RNA檢測,不管在專一性和靈敏度,都比快篩好很多。
如果現場想要做到這一些,就必須建置PCR的實驗室。十幾年前最精簡的實驗設備最少就要六、七萬美元,在這之外還要聘請學有專精、訓練有素的操作人員,基本上是很難做到的事情。所以說十幾年前,現場PCR檢測確實是藍海市場。
張:我們的檢測儀最特別的一點,就是同一套機器,但透過不同的試劑就可以做不同的產業應用。例如我在家裡,就可以用來測試基改豆漿;也可以測試某一地區的蚊子,是不是帶有登革熱病毒;用在養雞場,則可以偵測有沒有禽流感病毒。
不必改設計,Omicron 變異株也驗得到
問:新冠病毒現身沒多久就被科學家定出全基因組序列,那時候世界衛生組織(WHO)據此建議要採用哪一段序列做為PCR檢測標的。但病毒持續變異而有新的序列,PCR核酸檢測會需要調整試劑嗎?
鍾:我相信新冠病毒還會演化出很多不同的變異株,在檢測上大家最關心的是檢測工具能不能驗到這些病毒?從科學上對這個病毒的了解,不同基因片段的變異程度我們心裡都有個底。新冠病毒棘蛋白的基因序列會很快變異,所以我們當初在設計時,就選擇最保守、變化最小的那個區段。
2020年4月我們拿到台灣衛福部專案製造的授權之後,一直到現在,我們選用的偵測序列都沒有換過。不管是Alpha、Delta,甚至Omicron變異株,我們都驗得到。我們美國的合作單位也告訴我們,我們的設計很不錯,每次出現變異株,很多廠商都要改變引子與探針的序列設計,可是我們的產品不需要改變,還是可以偵測得到這些變異株。
問:這樣的話,醫事檢驗單位要如何知道病患是感染哪一種變異株?
鍾:應該這麼說,我們檢測儀是做檢測(detection),我們只需要定性,知道是SARS-CoV-2就好。若要知道是哪一種變異株,必須做全基因定序(sequencing),看棘蛋白S1、S2序列上有無變異,來確定是什麼變異株。
張:一旦確定出現新的變異株,例如最近的Omicron,很快就可以在美國國家生物科技資訊中心(NCBI)及全球共享流感數據倡議組織(GISAID)基因資料庫裡面找到它的序列。以瑞基來說,我們會時時上去比對我們現在使用的序列,到目前為止,98%都沒問題。可能會有一、兩株漏網之魚,那可能是在不同國家出現、我們認為不是最主流的感染株,但大方向沒問題。
這些發現與結果,我們都會陸續回報主管機關。衛福部也會持續關注我們的產品需不需要做變更,因為衛福部也用我們的試劑和儀器去做檢測,會要求這些通過專案製造的廠商持續回饋檢測產品的有效性。
問:如果未來新冠肺炎是會繼續流行的疾病,人病產品會變成你們公司的主力嗎?
鍾:基本上我們目前聚焦在新冠病毒的檢測,但實際上在未來如果有人出現呼吸道疾病症狀,是否是得到新冠肺炎或者是感染流感病毒、肺炎黴漿菌等,其實是必須釐清的,因此這些呼吸道疾病都會在我們的產品組合規劃裡。未來為了確認患者是得到流感或新冠肺炎,PCR檢測將成為受到重視的一環。
問:PCR檢測儀最後會普遍在診所看得到嗎?
張:我們覺得COVID-19會讓它會朝著這個方向發展。大部份醫院當初沒有採購PCR的機器或設備,現在因為疫情,相關採購也在規劃中。我們原本就思考,當新冠肺炎的病例少了要怎麼辦?所以一開始就圍繞著新冠肺炎相關的上呼吸道問題,開展不同的產品組合。
問:如果PCR檢測儀普遍進入診所,可能還是需要滿足一些其他要求,例如等待的時間不能太久。
張:以我們目前的桌上型自動化核酸分析儀POCKIT Central來說,等待時間是85分鐘;類似的國際競品,等待時間大概是半小時到一小時。兩者速度會差這麼多,是因為檢測的樣本數量不同,他們一次只檢測一個樣本,花費時間比較短,而我們的儀器一次可檢測八個樣本。未來若檢測需求量大增,在法規允許的情況下,我們的儀器可以採池化(pooling)的方式來檢驗……
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